Сотрудники, занимающиеся вопросами мобилизационной подготовки и гражданской обороны, разрабатывают мобилизационные планы, планируют и проводят мероприятия по мобилизационной подготовке и гражданской обороне, создают и поддерживают в состоянии постоянной готовности к использованию локальные системы оповещения, обучают сотрудников УИС способам защиты от опасностей, возникающих при ведении военных действий, проводят мероприятия по поддержанию устойчивого функционирования учреждений в военное время.
Основной задачей мобилизационных подразделений является обеспечение мобилизационной готовности учреждений уголовно-исполнительной системы.